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高效沸腾干燥机在生产过程中会覆盖一层保护层，可以减缓高效
沸腾干燥机的腐蚀程度。在现有的生产技术水平上，高效沸腾干燥机的保护层一般是金属保护层和非金属保护层。
高效沸腾干燥机的金属保护层主要采用电镀、喷涂、化学镀等方法，高效沸腾干燥机采用合金金属作为耐腐蚀层。
高效沸腾干燥机保护层的一个简单方法是在表面涂一层油漆，涂在高效沸腾干燥机表面。最终固化的油漆会形成一层薄薄的涂层，可以在一定程度上保护高效沸腾干燥机的腐蚀。这是一种非金属保护层，除此之外，还有许多其他的非金属保护层。
为高效沸腾干燥机制作非金属保护层，也可在干燥机允许的部分制作硬、软聚氯乙烯。硬、软聚氯乙烯具有良好的耐腐蚀性，HIA具有一定的机械强度，易于焊接和成型。但并不是所有高效沸腾干燥机的地方都能做硬、软聚氯乙烯保护层，因为它的耐磨性不是很好，所以只是在可以的地方做这样的保护层。
